De två huvuddelarna av Ekvatorialguinea, fastlandsdelen och ön Bioko, hade helt separat historia fram till 1800-talet, då de sammanfördes till en spansk koloni. På Bioko hade bubifolket ett kungadöme före européernas ankomst. På fastlandet var bland annat folkgrupperna bujeba, belungue och kombe organiserade i olika klansamhällen.
Den portugisiske sjöfararen Fernando Póo landsteg första gången 1469 på ön Bioko. I mitten av 1700-talet vandrade krigar- och jägarfolket fang från nuvarande Kamerun in i det som nu är fastlandsdelen av Ekvatorialguinea. De folkgrupper som levde där drevs mot kusten.
